approfondimenti
Lavori con l'RNA? Fallo a regola d'arte!
10' tempo di lettura
approfondimenti
10' tempo di lettura
Come lavorare con l'RNA?
🧪Consumabili >
✔️ >Utilizzare
provette in polipropilene, monouso, sterili e
>puntali >sterili, esenti da RNasi. >
✔️ >Per quanto possibile, mantenere le provette chiuse durante la preparazione. >
✔️ >Prima dell'uso, la vetreria dovrebbe essere trattata in
stufa per almeno 2 ore a 250 °C. >
🧤Ambiente di lavoro >
✔️ >Indossare
guanti durante la preparazione di RNA e cambiarli frequentemente in modo da creare un ambiente di lavoro il più
possibile esente da RNasi. >
✔️ >Evitare di operare in prossimità di eventuali altre analisi che impieghino RNasi. >
✔️ >Se usi RNasi per altre analisi, cambia il
camice prima di iniziare la preparazione di RNA. >
✔️ >L'ideale sarebbe dedicare una
specifica postazione
alla preparazione esclusiva di RNA. >
✔️ >Minimizza le comunicazioni durante la preparazione o utilizza una
mascherina per prevenire che goccioline di saliva contenenti RNAsi interferiscano con il tuo campione. >
>📌Congelamento in azoto liquido;
📌Stoccaggio in
>ultracongelatori a -80 °C >;
📌Utilizzo di reagenti stabilizzanti come NucleoProtect® RNA;
📌Evita lo scongelamento dei campioni prima del contatto con il buffer di lisi! >
📑Preparazione del campione >
✔️ >Mantieni
l'attrezzatura fredda
e esegui la preparazione del campione in azoto liquido. Se hai difficoltà, controlla i protocolli
Macherey Nagel per i kit RNA: contengono istruzioni specifiche per la corretta preparazione dei tuoi
campioni. >
🌡️Stoccaggio >
✔️ >Conserva sempre l'RNA eluito in ghiaccio per garantire una stabilità ottimale. Conservalo a
-20°C per brevi
periodi e a > -70°C per lungo termine >. >
✔️ >Se devi accedere all'RNA isolato frequentemente,
aliquotalo in piccoli volumi in modo da evitare successivi cicli di congelamento-decongelamento che riducono
l'integrità dell'RNA. >
✔️ >Quando scongeli i tuoi campioni, fallo sempre in
ghiaccio
per evitare la degradazione dell'RNA. >
La tua sfida, la nostra soluzione
| Sangue | Batteri e lieviti | |||||
Sfida ✔️Anticoagulanti (tipicamente EDTA) che possono inibire le analisi successive. |
Soluzione ✔️Lavaggio con 2 diversi tamponi per la rimozione di sali, metaboliti e macromolecole cellulari. |
|
Sfida ✔️Distruzione della struttura fisica della cellula. |
Soluzione
✔️Lisi del campione mediante biglie con provette MN Bead tipo B (biglie in vetro) (non incluse) |
| |
| Plasma e fluidi biologici | Piante e funghi | |||||
|
Sfida ✔️Purificazione di small RNAs. |
Soluzione
✔️Speciale chimica del tampone che permette la purificazione di small RNAs (>18 nt). |
|
Sfida
✔️Inibitori come amido, zucchero, |
Soluzione
✔️2 differenti tamponi per rimuovere le impurità e i metaboliti; |
| |
| Virus | Insetti | |||||
|
Sfida
✔️Bassa concentrazione di virus; |
Soluzione
✔️RNA carrier che aumentano il la capacità legante e il recupero; |
|
Sfida ✔️Struttura fisica e biochimica dei gusci in chitina. |
Soluzione
✔️Lisi del campione mediante biglie con provette MN Bead tipo G |
| |
| Cellule e tessuti | Terreno | |||||
|
Sfida
✔️Omogeneizzazione dei campioni incluso tessuti di topo |
Soluzione
✔️Facile omogeneizzazione del campione |
|
Sfida ✔️Inibitori come polisaccaridi, urati e lipidi; |
Soluzione
✔️La combinazione dell'omogeneizzazione meccanica e della lisi chimica permette un'ottimale
resa dell'RNA; |
| |
| FFPE-tessuti | Feci | |||||
|
Sfida ✔️Rimozione paraffine; |
Soluzione
✔️Dissolutore di formalina (in attesa di brevetto); |
|
Sfida
✔️Composizione del campione non standard |
Soluzione
✔️Lisi del campione mediante biglie con provette MN Bead tipo A |
| |