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5'...G A T N N#N N A T C...3' 3'...C T A N N#N N T A G...5' L'enzima di restrizione BseJI riconosce i siti GATNN^NNATC e taglia a 65°C in 5-15 minuti usando il tampone universale FastDigest Buffer. Questo enzima è un isoschizomero di BsaBI avente la stessa specificità (Isoschizomeri: Bse8I).