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5'...G K G C M#C...3' 3'...C#M C G K G...5' L'enzima di restrizione BseSI riconosce i siti GKGCM^C e taglia a 55°C in 5-15 minuti usando il tampone universale FastDigest Buffer. Questo enzima è un isoschizomero di Bme1580I avente la stessa specificità (Isoschizomeri: BaeGI, BstSLI).