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5'...G C A A T G N N#...3' 3'...C G T T A C#N N ...5' L'enzima di restrizione BseMI riconosce i siti GCAATG(2/0)^ e taglia a 55°C in 5-15 minuti usando il tampone universale FastDigest Buffer. Questo enzima è un isoschizomero di BsrDI avente la stessa specificità (Isoschizomeri: Bse3DI).