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5'...G A C G C (N) 5#...3' 3'...C T G C G (N)10#...5' L'enzima di restrizione CseI riconosce i siti GACGC(5/10)^ e taglia a 37°C in 5-15 minuti usando il tampone universale FastDigest Buffer. Questo enzima è un isoschizomero di HgaI avente la stessa specificità (Isoschizomeri: HgaI).