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5'...G G G A C (N)10#...3' 3'...C C C T G (N)14#...5' L'enzima di restrizione FaqI riconosce i siti GGGAC(10/14)^ e taglia a 37°C in 5-15 minuti usando il tampone universale FastDigest Buffer. Questo enzima è un isoschizomero di BsmFI avente la stessa specificità (Isoschizomeri: BslFI).