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5'...G C A T G#C...3' 3'...C#G T A C G...5' L'enzima di restrizione PaeI riconosce i siti GCATG^C e taglia a 37°C in 5-15 minuti usando il tampone universale FastDigest Buffer. Questo enzima è un isoschizomero di SphI avente la stessa specificità (Isoschizomers: BbuI).