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5'...C C T N N#N N N A G G...3' 3'...G G A N N N#N N T C C...5' L'enzima di restrizione XagI riconosce i siti CCTNN^NNNAGG e taglia a 37°C in 5-15 minuti usando il tampone universale FastDigest Buffer. Questo enzima è un isoschizomero di EcoNI avente la stessa specificità (Isoschizomeri: BstENI).