La tecnologia dell’analisi di Single Cell ha svelato la complessità dei sistemi biologici fornendo una risoluzione senza precedenti e evidenziando rilevanti differenze esistenti tra le cellule. Sempre di più questi studi vengono applicati a sistemi biologici complessi come campioni clinici e sappiamo bene che, come ricercatore, ogni giorno devi affrontare enormi sfide per ottenere il massimo dai tuoi esperimenti di single cell analisi.

Spesso ti trovi a fronteggiare, al termine dell’esperimento, metriche qualitative come ”Fraction Reads in Cells” o “Median UMI Counts per Cell” scoraggianti che, dopo tutto l’impegno profuso, sia economico che intellettuale, potrebbero precluderti lo studio di particolari tipologie di campioni, per loro natura complessi, per cui risulta particolarmente difficoltoso riuscire ottenere una sospensione cellulare di qualità tale da essere processati con le principali piattaforme di single cell.

Scopri come tutto ciò può cambiare con un semplice passaggio di arricchimento e come facilmente puoi ottenere il massimo dai tuoi esperimenti di scSEQ: NOTA APPLICATIVA.

Hai mai pensato inoltre che le procedure utilizzate per la preparazione del campione possano alterare drasticamente l’output di dati ottenuti? 

Dopo alcuni anni di esperienza sul campo, parecchi ricercatori hanno evidenziato l’esistenza di “cluster” fortemente influenzati dalle procedure utilizzate per la preparazione del campione. 

Questo fenomeno è rilevante per alcune tipologie di cellule particolarmente sensibili come i diversi sottotipi cellulari cerebrali, inclusi neuroni, astrociti, oligodendrociti e cellule della microglia. 
Grazie all’utilizzo dei kit Leviprep e alla tecnologia di separazione cellulare basata sulla levitazione magnetica di LeviCell system, è stato possibile ridurre notevolmente l’attivazione di pathways genici di risposta a stress come il Lysosomal genes (CD68, LYZ2), o Interferon response genes (IFIT3, IRF7) rispetto all’utilizzo del FACS come metodologia di preparazione del campione: NOTA APPLICATIVA.

Il tuo ambito di ricerca è l’oncologia? Spesso, lavorando con preziose biopsie oncologiche e con sospensioni cellulari derivate da tumori primari, potrebbe essere utile rimuovere dal campione la componente cellulare immunitaria per concentrarsi sulla caratterizzazione delle alterazioni cellulari delle cellule tumorali o valutare anche variazioni di sottopopolazioni cellulari resistenti a trattamenti farmacologici. Grazie al LeviSelect Human CD45 Depletion kit (FB01004001) puoi, in un unico passaggio, preparare il campione per la tua analisi single cell eliminando detriti, dead cell e RNA ambientale. Contemporaneamente, utilizzando LeviSelect, puoi sottrarre la componente immunologica e tutte le cd45+ expressing cells in una singola corsa con LeviCell : NOTA APPLICATIVA

Tutto questo in 3 semplici passaggi:

Ottieni il massimo dai tuoi campioni e richiedi una demo al seguente indirizzo: servizioclienticer@dgroup.it.